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药学学科为一级博士学位授权点和一级硕士学位授权点，包括药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、药理学等博士和硕士二级学位授权点。其中，药学学科为必发88官网优势特色重点学科、必发88官网重中之重学科和“十三五”必发88官网特色高水平学科（A类），民族药学（朝药学）为必发88官网中医药管理局重点学科，在教育部学位与研究生教育发展中心第四轮学科评估中，药学学科名列B-。目前，在校硕士研究生有235名，博士研究生43名，有国外留学生4名。在《中国学位与研究生教育及学科专业评价报告》中，药学学科一直排名20.71%、21.83%和26.57%。

学院双聘中国工程院陈芬儿院士成立必发88官网手性药物工程研究中心和必发88官网制药工程创新研究中心，引进“外专千人计划”学者建立必发88官网高校药物靶点与药物活性筛选重点实验室和必发88官网分子药物研究中心。现有专职教师47名，其中正教授14名，副教授16名，讲师11名，助教6名。教师队伍中有必发88官网长白山学者2人、必发88官网高级专家1人、必发88官网学科领军教授1人、国务院特贴专家1人、宝钢优秀教师1人、必发88官网拔尖创新人才5人、必发88官网有突出贡献的中青年专业技术人才3人、必发88官网新世纪优秀人才2人、必发88官网创新创业人才2人和科研春苗计划人才1人。

近年来，药学院以长白山道地药材和朝鲜族民族药为研究对象，先后承担必发88官网重大新药创制专项2项，必发88官网级及省部级科研项目105项，其中必发88官网自然科学基金项目56项，研究经费达5千余万元；发表论文443篇，其中SCI论文288篇。获得必发88官网科技进步二等奖3项、三等奖5项，必发88官网自然科学三等奖1项。获得必发88官网优秀博士论文4篇，校优秀博士论文11篇；必发88官网优秀硕士学位论文9篇，校优秀硕士论文21篇。

以药学学科为依托，建设有长白山生物资源与功能分子教育部重点实验室、必发88官网外专局生物资源与功能分子学科创新111引智基地、必发88官网中医药管理局民族药（朝药）重点实验室、必发88官网高校高端科技创新平台、中国朝鲜族传统医药研究国际合作基地、必发88官网手性药物工程研究中心、必发88官网高校药物靶点与药物活性筛选重点实验室、必发88官网高校朝药研究重点实验室、必发88官网朝医药产业公共技术研发中心、必发88官网医药健康产业研发中心、必发88官网医药健康产业中试基地、必发88官网分子药物研究中心、必发88官网制药工程创新研究中心、吉林敖东药业博士后科研基地（共建）、吉林敖东药业博士研究生工作站（共建）等。本学科经过40余年的建设与发展，已成为必发88官网乃至全国重要的高层次药学拔尖创新人才培养基地。